Σύνοψη
Το ΙΝΕΒ | ΕΚΕΤΑ δραστηριοποιείται στην παραγωγή, τη διαχείριση και την ανάλυση βιοδεδομένων μεγάλου όγκου (Big Data) σε όλες τις επικράτειες της ζωής στα πλαίσια μελετών Next Generation Sequencing (NGS) που εκτείνονται από τις μικροβιακές κοινότητες στα φυτά και τα ζώα, τα τρόφιμα και τον άνθρωπο.
Πιο συγκεκριμένα, το ΙΝΕΒ | ΕΚΕΤΑ διαθέτει εμπειρία και εξειδίκευση σε πολλές τεχνολογικές και μεθοδολογικές προσεγγίσεις, μεταξύ άλλων: (i) whole exome sequencing, (ii) DNA methylome sequencing, (iii) ανάλυση μεταγραφώματος (RNA-seq και Ribo-seq), (iv) στοχευμένη NGS αλληλούχηση (targeted NGS sequencing), (v) μεταγονιδιωματική και (vi) πρωτεομική ανάλυση, μεταξύ άλλων, με κοινό χαρακτηριστικό την παραγωγή βιοδεδομένων μεγάλου όγκου. Πράγματι, μια και μόνο μελέτη μπορεί να αποδώσει αρκετές εκατοντάδες Gigabytes δεδομένων, υπογραμμίζοντας την ανάγκη μιας ισχυρής υπολογιστικής υποδομής, όπως η εγκατεστημένη υποδομή στο ΙΝΕΒ | ΕΚΕΤΑ (Παράρτημα VI), ώστε να διασφαλιστεί αποτελεσματική ανάλυση που μπορεί να οδηγήσει σε αξιόπιστα αποτελέσματα.
Στο πλαίσιο της επεξεργασίας και ανάλυσης βιοδεδομένων μεγάλου όγκου, επισημαίνονται οι στενοί δεσμοί του ΙΝΕΒ | ΕΚΕΤΑ με καθιερωμένες Ευρωπαϊκές e-υποδομές, π.χ. EGI, EUDAT και RDA. Επίσης, το Ινστιτούτο είναι μέλος σημαντικών συνεργατικών ερευνητικών δικτύων (π.χ. Euroclonality-NGS), έχοντας έτσι τη δυνατότητα να διατηρεί την ανταγωνιστικότητά του στο συνεχώς μεταβαλλόμενο περιβάλλον των υπολογιστικών προκλήσεων αλλά επίσης και να αλληλεπιδρά με σημαντικούς φορείς και ερευνητές και, έτσι, να συμβάλει στη διαμόρφωση μελλοντικών πολιτικών.
Αγρο-Βιοτεχνολογία Βιοϊατρική Έρευνα