Η υπολογιστική υποδομή του ΙΝΕΒ είναι το θεμέλιο για την ανάλυση βιοδεδομένων μεγάλης κλίμακας. Λειτουργεί ως οριζόντια υποδομή που υποστηρίζει όλους τους τομείς του Ινστιτούτου. Κύρια λειτουργία της είναι η επεξεργασία και αποθήκευση κλινικών δεδομένων, δεδομένων αλληλούχησης και πληθυσμιακών μελετών όπως επίσης και η ανάλυση και μοντελοποίηση βιολογικών διεργασιών. Η κύρια υποδομή βασίζεται σε ένα high-performance computer cluster με μεγάλο αποθηκευτικό χώρο, με δικαιώματα χρήσης από όλους τους ενδιαφερόμενους βιοεπιστήμονες στην Ελλάδα και διεθνώς.
Η υποδομή αλληλούχησης του ΙΝΕΒ δραστηριοποιείται σε έρευνα και υπηρεσίες που βασίζονται στις παρακάτω μεθοδολογίες: (i) whole genome sequencing, (ii) whole exome sequencing, (iii) transcriptome sequencing, (iv) single-cell RNA sequencing, (v) targeted NGS sequencing kai (vi) metagenomics. Η υποδομή αλληλούχησης ασχολείται ενεργά με την ανάπτυξη και εφαρμογή νέων πρωτοκόλλων. Συνδέεται με την υπολογιστική υποδομή ώστε να εξασφαλίζει ευκολία πρόσβασης σε όλα τα εργαστήρια και τους εξωτερικούς συνεργάτες.
Το ΙΝΕΒ διαθέτει σύγχρονες εγκαταστάσεις βιοχημικής και μεταβολομικής ανάλυσης οι οποίες υποστηρίζουν τις ερευνητικές του δραστηριότητες (i) υγρή χρωματογραφία υψηλής απόδοσης συζευγμένη με ανιχνευτή συστοιχίας διόδων (DAD), UV-Vis και δείκτη διάθλασης (RI), (ii) αέρια χρωματογραφία με ανίχνευση ιονισμού φλόγας (GC-FID) και φασματομετρία μάζας (GC-MS), (iii) υγρή χρωματογραφία συζευγμένη με διαδοχική φασματομετρία μάζας (LC-MS/MS), φασματοφωτόμετρα UV-Vis και διαχωριζόμενης δέσμης, συσκευές προσδιορισμού φθορισμού, χημειοφωταύγειας και UV-VIS με χρήση πλακών μικροτιτλοδότησης (microplate readers).
Η υποδομή Μικροσκοπίας & Απεικόνισης χρησιμοποιείται για την παρατήρηση καλλιεργειών κυτταρικών σειρών και πρωτογενών κυττάρων από ασθενείς και υγιείς δότες. Περιλαμβάνει ανάστροφα μικροσκόπια, μικροσκόπια φθορισμού και ένα επιτραπέζιο ZOE Cell Imager για την αποθήκευση και σύνθεση εικόνων πολλαπλών χρωμάτων.
Η πειραματική υποδομή ανάπτυξης φυτών στο INΕB είναι ένα ουσιαστικό εργαλείο που συνδέει την πρωτογενή βασική έρευνα και τα μοριακά δεδομένα μεγάλης κλίμακας με την εφαρμοσμένη έρευνα πεδίου. Η υποδομή περιλαμβάνει θαλάμους ανάπτυξης φυτών και ασχολείται με τη μελέτη της ανάπτυξης των φυτών, τη βλάστηση των σπόρων, τον εγκλιματισμό των φυτών σε βιοτικές και αβιοτικές καταπονήσεις, την ανάπτυξη των φυτικών κυττάρων και των ιστών, τις γενετικές τροποποιήσεις των φυτών και τις καλλιέργειες κυτταροπλάσματος και κυττάρων.
Το ΙΝΕΒ πραγματοποιεί συστηματική συλλογή βιολογικών δειγμάτων από ασθενείς και υγιείς δότες, σύμφωνα με τις βέλτιστες πρακτικές που έχουν θεσπιστεί διεθνώς καθώς και τη σχετική ελληνική και ευρωπαϊκή νομοθεσία. Το ΙΝΕΒ συμμετέχει επίσης στην προτυποποίηση των διαδικασιών καταγραφής, επεξεργασίας, αποθήκευσης και χρήσης των δειγμάτων. Η Υποδομή Βιοτράπεζας του ΙΝΕΒ αποτελεί κόμβο του BBMRI-ERIC (Biobanking and BioMolecular Research Initiative - European Research Infrastructure Consortium).
Σπόροι: H βιοτράπεζα σπόρων του INΕB συλλέγει και συντηρεί σπόρους τόσο από άγρια όσο και από καλλιεργούμενα είδη και ποικιλίες, που αποτελούν μία πολύτιμη γονιδιακή δεξαμενή για τη μελέτη και τη βελτίωση ειδών και ποικιλιών. Μικρόβια: H βιοτράπεζα μικροβίων συλλέγει και διατηρεί μικροβιακές κοινότητες και απομονωμένους μικροοργανισμούς οικονομικού ενδιαφέροντος από όλους τους τομείς δραστηριότητας στον αγροδιατροφικό τομέα. Περιέχει επίσης νέους και βελτιωμένους μικροοργανισμούς που είναι αποτέλεσμα προγραμμάτων επιλογής και εξέλιξης.
Η Υποδομή Κυτταρικών Αναλύσεων επικεντρώνεται σε εφαρμογές κυτταρομετρίας ροής και διαχωρισμού κυτταρικών υποπληθυσμών. Επίσης, η υποδομή περιλαμβάνει αναλυτή μεταβολικών ροών που μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την παρακολούθηση της μεταβολικής δραστηριότητας παθολογικών και υγιών κυττάρων υπό διάφορες συνθήκες.
